Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms