Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms