Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DESP17661 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DESP17661 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DESP17661 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DESP17661 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DESP17661 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DESP17661 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms