Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms