Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG2P13727 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms