Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTN1P12814 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms