Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F5P12259 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F5P12259 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F5P12259 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F5P12259 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F5P12259 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F5P12259 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F5P12259 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F5P12259 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F5P12259 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F5P12259 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F5P12259 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F5P12259 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms