Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms