Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM200BP0CF97 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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