Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG7O95352 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG7O95352 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG7O95352 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG7O95352 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG7O95352 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG7O95352 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG7O95352 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG7O95352 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG7O95352 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG7O95352 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG7O95352 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG7O95352 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG7O95352 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG7O95352 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG7O95352 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG7O95352 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG7O95352 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG7O95352 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG7O95352 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG7O95352 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms