Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDSO60760 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPGDSO60760 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPGDSO60760 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPGDSO60760 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDSO60760 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDSO60760 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDSO60760 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDSO60760 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDSO60760 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDSO60760 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms