Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms