Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTATSF1O43719 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms