Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIP1O00291 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIP1O00291 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HIP1O00291 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HIP1O00291 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIP1O00291 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIP1O00291 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIP1O00291 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HIP1O00291 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIP1O00291 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIP1O00291 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIP1O00291 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms