Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms