Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC4-APOC2K7ER74 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms