Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms