Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf98E9PRG8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf98E9PRG8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms