Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN6Q9Y6Q1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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