Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms