Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms