Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CROTQ9UKG9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CROTQ9UKG9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms