Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPN3Q9UHW5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms