Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms