Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms