Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
REREQ9P2R6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms