Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms