Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms