Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms