Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSPNQ9HAW4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms