Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms