Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPO3Q9BXY4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms