Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms