Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPOQ9BU64 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPOQ9BU64 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPOQ9BU64 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPOQ9BU64 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPOQ9BU64 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPOQ9BU64 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms