Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms