Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms