Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms