Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms