Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms