Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms