Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms