Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms