Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms