Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PROX1Q92786 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms