Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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