Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMGNT2Q8NAT1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms