Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms