Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAAF3Q8N9W5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAAF3Q8N9W5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms