Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF148Q8N7C7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms