Protein–RNA interactions for Protein: Q8N668

COMMD1, COMM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD1Q8N668 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COMMD1Q8N668 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD1Q8N668 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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